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Prof. Lyre ist Inhaber des Lehrstuhls für Theoretische Philosophie und Leiter des Studiengangs Philosophie – Neurowissenschaften – Kognition an der Universität Magdeburg. Seine Forschungsgebiete liegen in der Wissenschaftstheorie der kognitiven computationalen Neurowissenschaften und der Künstlichen Intelligenz. Zu seinen Spezialthemen zählen strukturale Repräsentation in der Kognition und strukturale Modelle des Phänomenalen, mentaler Externalismus und Extended Cognition, Strukturenrealismus, Reduktionismus und Multirealisierbarkeit. Frühere Forschungsinteressen betrafen Grundlagen von Quanten- und Informationstheorie, Eichsymmetrien und Kants Naturphilosophie.